Par le mycélium, les champignons transforment le sol.
Ils décomposent* les feuilles, les déchets végétaux et animaux et ils s'en nourrissent. Ils sont saprophytes. Ils aident ainsi à la formation des sols, et c'est en partie grâce à eux que se forme l'humus qui rend la terre fertile.

En détruisant les débris animaux et végétaux, les champignons saprophytes « nettoient » la nature et recyclent les éléments minéraux, qui seront remis à la disposition des plantes, puis des animaux.

Les champignons participent aussi, par des échanges gazeux et chimiques, à toute la vie de la terre.
Ils jouent un rôle particulièrement essentiel dans le biotope** de la forêt :
- ils participent à la formation du sol et permettent à des végétaux de pousser ;
- ils permettent donc aux arbres de la forêt d'exister.

Les lichens qui poussent sur la roche, les tuiles, les troncs d'arbres sont formés par l'association d'une algue et d'un champignon. Grâce à eux, un peu de sol se forme dans un trou où les plantes peuvent alors pousser.